Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd1A2AKB4 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms