Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac5Q9Z2V6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Hdac5Q9Z2V6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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