Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ubl3Q9Z2M6 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms