Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms