Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Syngr4Q9Z1L2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Syngr4Q9Z1L2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms