Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms