Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms