Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Atg3Q9CPX6 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Atg3Q9CPX6 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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