Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hdac9Q99N13 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hdac9Q99N13 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hdac9Q99N13 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hdac9Q99N13 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Hdac9Q99N13 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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