Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms