Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b4Q99ME6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms