Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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TrabdQ99JY4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
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TrabdQ99JY4 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TrabdQ99JY4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TrabdQ99JY4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TrabdQ99JY4 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TrabdQ99JY4 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TrabdQ99JY4 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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