Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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