Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Slc8b1Q925Q3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms