Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TardbpQ921F2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TardbpQ921F2 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TardbpQ921F2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TardbpQ921F2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TardbpQ921F2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms