Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cabp4Q8VHC5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cabp4Q8VHC5 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms