Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms