Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms