Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms