Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Abcf3Q8K268 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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