Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms