Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms