Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp40Q8BWR4 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp40Q8BWR4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp40Q8BWR4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp40Q8BWR4 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp40Q8BWR4 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp40Q8BWR4 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp40Q8BWR4 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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