Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Htatsf1Q8BGC0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms