Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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