Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms