Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
ParpbpQ6IRT3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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