Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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