Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf608Q56A10 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms