Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms