Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Sf3b2Q3UJB0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Sf3b2Q3UJB0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms