Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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Q3U6N9 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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