Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ccndbp1Q3TVC7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms