Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms