Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Grin2cQ01098 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms