Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pde1bQ01065 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms