Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms