Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shc1P98083 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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