Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VdrP48281 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VdrP48281 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VdrP48281 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VdrP48281 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VdrP48281 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VdrP48281 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VdrP48281 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
VdrP48281 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VdrP48281 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms