Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms