Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfraP26618 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms