Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tap1P21958 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tap1P21958 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tap1P21958 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tap1P21958 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tap1P21958 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tap1P21958 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tap1P21958 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms