Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pou4f1P17208 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms