Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Smim18J3QNP2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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