Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms