Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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