Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fndc1E9Q043 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms