Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3543D3Z235 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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