Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmf1B9EKI3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms