Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Phf11bB4XVQ1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Phf11bB4XVQ1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Phf11bB4XVQ1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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